Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPD2P43304 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPD2P43304 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPD2P43304 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPD2P43304 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPD2P43304 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPD2P43304 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPD2P43304 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPD2P43304 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPD2P43304 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPD2P43304 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPD2P43304 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPD2P43304 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPD2P43304 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPD2P43304 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPD2P43304 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPD2P43304 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPD2P43304 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPD2P43304 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPD2P43304 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPD2P43304 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPD2P43304 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPD2P43304 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPD2P43304 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPD2P43304 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPD2P43304 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPD2P43304 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPD2P43304 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPD2P43304 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPD2P43304 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPD2P43304 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPD2P43304 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPD2P43304 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPD2P43304 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPD2P43304 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms