Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A3P43003 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms