Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 YLR118CYLR118C 684 nt5.66□□□□□ -1.5
UFE1P41834 SNZ2YNL333W 897 nt5.66□□□□□ -1.5
UFE1P41834 YMR155WYMR155W 1644 nt5.66□□□□□ -1.5
UFE1P41834 BUL1YMR275C 2931 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 EMW1YNL313C 2715 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 MRPL13YKR006C 795 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 VMA4YOR332W 702 nt5.65□□□□□ -1.5
UFE1P41834 PKC1YBL105C 3456 nt5.65□□□□□ -1.51
UFE1P41834 PYC1YGL062W 3537 nt5.65□□□□□ -1.51
UFE1P41834 TIM54YJL054W 1437 nt5.65□□□□□ -1.51
UFE1P41834 ADE13YLR359W 1449 nt5.65□□□□□ -1.51
UFE1P41834 GPT2YKR067W 2232 nt5.64□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YGR182CYGR182C 354 nt5.64□□□□□ -1.51
UFE1P41834 GAT4YIR013C 366 nt5.64□□□□□ -1.51
UFE1P41834 CIS3YJL158C 684 nt5.64□□□□□ -1.51
UFE1P41834 PGA3YML125C 939 nt5.64□□□□□ -1.51
UFE1P41834 ASN1YPR145W 1719 nt5.64□□□□□ -1.51
UFE1P41834 VPS4YPR173C 1314 nt5.64□□□□□ -1.51
UFE1P41834 IMA5YJL216C 1746 nt5.63□□□□□ -1.51
UFE1P41834 ACC1YNR016C 6702 nt5.63□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YDL057WYDL057W 987 nt5.63□□□□□ -1.51
UFE1P41834 OAC1YKL120W 975 nt5.63□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YLL059CYLL059C 507 nt5.63□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.63□□□□□ -1.51
UFE1P41834 SMF2YHR050W 1650 nt5.63□□□□□ -1.51
UFE1P41834 TRK2YKR050W 2670 nt5.62□□□□□ -1.51
UFE1P41834 GUP2YPL189W 1830 nt5.62□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YDL034WYDL034W 345 nt5.62□□□□□ -1.51
UFE1P41834 COX9YDL067C 180 nt5.62□□□□□ -1.51
UFE1P41834 VBA1YMR088C 1689 nt5.62□□□□□ -1.51
UFE1P41834 PAP2YOL115W 1755 nt5.62□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YGL036WYGL036W 2730 nt5.61□□□□□ -1.51
UFE1P41834 SHE10YGL228W 1734 nt5.61□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YKL151CYKL151C 1014 nt5.61□□□□□ -1.51
UFE1P41834 COS9YKL219W 1224 nt5.61□□□□□ -1.51
UFE1P41834 SEC13YLR208W 894 nt5.61□□□□□ -1.51
UFE1P41834 ERI1YPL096C-A 207 nt5.61□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YCL041CYCL041C 495 nt5.61□□□□□ -1.51
UFE1P41834 UGO1YDR470C 1509 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 RNR3YIL066C 2610 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YJL171CYJL171C 1191 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 LDB18YLL049W 540 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 PNP1YLR209C 936 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YML6YML025C 861 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 HSP104YLL026W 2727 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 STL1YDR536W 1710 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 AAP1YHR047C 2571 nt5.6□□□□□ -1.51
UFE1P41834 MID1YNL291C 1647 nt5.59□□□□□ -1.51
UFE1P41834 SET5YHR207C 1581 nt5.59□□□□□ -1.51
UFE1P41834 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.59□□□□□ -1.51
UFE1P41834 ERG3YLR056W 1098 nt5.59□□□□□ -1.51
UFE1P41834 CBC2YPL178W 627 nt5.59□□□□□ -1.51
UFE1P41834 SOG2YOR353C 2376 nt5.58□□□□□ -1.52
UFE1P41834 GAA1YLR088W 1845 nt5.58□□□□□ -1.52
UFE1P41834 YEH1YLL012W 1722 nt5.58□□□□□ -1.52
UFE1P41834 SLO1YER180C-A 258 nt5.58□□□□□ -1.52
UFE1P41834 PRM10YJL108C 1152 nt5.58□□□□□ -1.52
UFE1P41834 RDL2YOR286W 450 nt5.58□□□□□ -1.52
UFE1P41834 HSP26YBR072W 645 nt5.58□□□□□ -1.52
UFE1P41834 FLC3YGL139W 2409 nt5.57□□□□□ -1.52
UFE1P41834 NOB1YOR056C 1380 nt5.57□□□□□ -1.52
UFE1P41834 GFD1YMR255W 567 nt5.57□□□□□ -1.52
UFE1P41834 MTC5YDR128W 3447 nt5.57□□□□□ -1.52
UFE1P41834 ERG7YHR072W 2196 nt5.57□□□□□ -1.52
UFE1P41834 YJR015WYJR015W 1533 nt5.57□□□□□ -1.52
UFE1P41834 MHR1YDR296W 681 nt5.56□□□□□ -1.52
UFE1P41834 RPT6YGL048C 1218 nt5.56□□□□□ -1.52
UFE1P41834 RPS15YOL040C 429 nt5.56□□□□□ -1.52
UFE1P41834 MMP1YLL061W 1752 nt5.56□□□□□ -1.52
UFE1P41834 VTH1YIL173W 4650 nt5.56□□□□□ -1.52
UFE1P41834 VTH2YJL222W 4650 nt5.56□□□□□ -1.52
UFE1P41834 ATP1YBL099W 1638 nt5.56□□□□□ -1.52
UFE1P41834 PRO3YER023W 861 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 YNR048WYNR048W 1182 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 YOR318CYOR318C 306 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 YPL062WYPL062W 405 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 SUE1YPR151C 621 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 YDR514CYDR514C 1452 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 RPT1YKL145W 1404 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 ECM3YOR092W 1842 nt5.55□□□□□ -1.52
UFE1P41834 ROG3YFR022W 2202 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 RPL7AYGL076C 735 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 RPL7BYPL198W 735 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 SSO1YPL232W 873 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 SAM4YPL273W 978 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 JIP4YDR475C 2631 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 YIR007WYIR007W 2295 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 QDR3YBR043C 2070 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 TEF1YPR080W 1377 nt5.54□□□□□ -1.52
UFE1P41834 TEF2YBR118W 1377 nt5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.3 ms