Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC1P41238 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC1P41238 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC1P41238 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC1P41238 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC1P41238 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC1P41238 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC1P41238 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC1P41238 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms