Protein–RNA interactions for Protein: P36000

APL2, AP-1 complex subunit beta-1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL2P36000 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 YUR1YJL139C 1287 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 COS9YKL219W 1224 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 YOL163WYOL163W 510 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 ERI1YPL096C-A 207 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 YCL041CYCL041C 495 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 PCL10YGL134W 1302 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 PRP24YMR268C 1335 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 DIA3YDL024C 1407 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 XBP1YIL101C 1944 nt6.89□□□□□ -1.31
APL2P36000 IES1YFL013C 2079 nt6.88□□□□□ -1.31
APL2P36000 ERC1YHR032W 1746 nt6.88□□□□□ -1.31
APL2P36000 STM1YLR150W 822 nt6.88□□□□□ -1.31
APL2P36000 PRE2YPR103W 864 nt6.88□□□□□ -1.31
APL2P36000 IFA38YBR159W 1044 nt6.88□□□□□ -1.31
APL2P36000 SKY1YMR216C 2229 nt6.88□□□□□ -1.31
APL2P36000 YPK2YMR104C 2034 nt6.88□□□□□ -1.31
APL2P36000 HXT17YNR072W 1695 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 YBR284WYBR284W 2394 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 YDL057WYDL057W 987 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 YER010CYER010C 705 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 REV7YIL139C 738 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 PNP1YLR209C 936 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 RPO26YPR187W 468 nt6.87□□□□□ -1.31
APL2P36000 PHO3YBR092C 1404 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 NMT1YLR195C 1368 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 SRP101YDR292C 1866 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 GPI11YDR302W 660 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 MMS21YEL019C 804 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 PRM10YJL108C 1152 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 ERG3YLR056W 1098 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 YLR118CYLR118C 684 nt6.86□□□□□ -1.31
APL2P36000 RTT106YNL206C 1368 nt6.85□□□□□ -1.31
APL2P36000 YDL034WYDL034W 345 nt6.85□□□□□ -1.31
APL2P36000 COX26YDR119W-A 201 nt6.85□□□□□ -1.31
APL2P36000 RPS2YGL123W 765 nt6.85□□□□□ -1.31
APL2P36000 YPL062WYPL062W 405 nt6.85□□□□□ -1.31
APL2P36000 TIM54YJL054W 1437 nt6.84□□□□□ -1.31
APL2P36000 YMR155WYMR155W 1644 nt6.84□□□□□ -1.31
APL2P36000 YHP1YDR451C 1062 nt6.84□□□□□ -1.31
APL2P36000 NCS6YGL211W 1080 nt6.84□□□□□ -1.31
APL2P36000 YJR115WYJR115W 510 nt6.84□□□□□ -1.31
APL2P36000 ATG7YHR171W 1893 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 GAT1YFL021W 1533 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 KSS1YGR040W 1107 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 TPK1YJL164C 1194 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 PGU1YJR153W 1086 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 RDL2YOR286W 450 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 SSO1YPL232W 873 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 RSP5YER125W 2430 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 SLX5YDL013W 1860 nt6.83□□□□□ -1.32
APL2P36000 MSS116YDR194C 1995 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 VPS72YDR485C 2388 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 EMW1YNL313C 2715 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 PYC1YGL062W 3537 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 CAD1YDR423C 1230 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 RPT6YGL048C 1218 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 CHL4YDR254W 1377 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 BNA5YLR231C 1362 nt6.82□□□□□ -1.32
APL2P36000 YME1YPR024W 2244 nt6.81□□□□□ -1.32
APL2P36000 YLR283WYLR283W 945 nt6.81□□□□□ -1.32
APL2P36000 TAL1YLR354C 1008 nt6.81□□□□□ -1.32
APL2P36000 TAF11YML015C 1041 nt6.81□□□□□ -1.32
APL2P36000 TAF4YMR005W 1167 nt6.81□□□□□ -1.32
APL2P36000 YPR123CYPR123C 435 nt6.81□□□□□ -1.32
APL2P36000 YIL092WYIL092W 1902 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 SHE10YGL228W 1734 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 YKL151CYKL151C 1014 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 PAP1YKR002W 1707 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 TFS1YLR178C 660 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 PIN2YOR104W 849 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 NOB1YOR056C 1380 nt6.8□□□□□ -1.32
APL2P36000 NUD1YOR373W 2556 nt6.79□□□□□ -1.32
APL2P36000 IPI1YHR085W 1005 nt6.79□□□□□ -1.32
APL2P36000 BUL1YMR275C 2931 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 YER186CYER186C 921 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 YGR182CYGR182C 354 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 YHR140WYHR140W 720 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 ICT1YLR099C 1185 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 HCR1YLR192C 798 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 PGA3YML125C 939 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 YNR048WYNR048W 1182 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 PET20YPL159C 762 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 HSP26YBR072W 645 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 MLC2YPR188C 492 nt6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 568.5 ms