Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCLP35914 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCLP35914 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HMGCLP35914 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCLP35914 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCLP35914 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCLP35914 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCLP35914 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCLP35914 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCLP35914 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms