Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORAP35398 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORAP35398 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RORAP35398 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORAP35398 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RORAP35398 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORAP35398 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORAP35398 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORAP35398 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RORAP35398 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RORAP35398 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORAP35398 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORAP35398 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORAP35398 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORAP35398 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORAP35398 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RORAP35398 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORAP35398 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORAP35398 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORAP35398 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORAP35398 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORAP35398 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORAP35398 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORAP35398 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORAP35398 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORAP35398 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RORAP35398 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RORAP35398 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RORAP35398 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RORAP35398 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RORAP35398 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RORAP35398 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORAP35398 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORAP35398 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORAP35398 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RORAP35398 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORAP35398 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORAP35398 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORAP35398 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORAP35398 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORAP35398 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORAP35398 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORAP35398 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORAP35398 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORAP35398 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORAP35398 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORAP35398 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORAP35398 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORAP35398 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms