Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SDC2P34741 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDC2P34741 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDC2P34741 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDC2P34741 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDC2P34741 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDC2P34741 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SDC2P34741 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDC2P34741 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDC2P34741 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDC2P34741 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDC2P34741 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDC2P34741 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDC2P34741 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDC2P34741 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDC2P34741 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDC2P34741 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDC2P34741 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDC2P34741 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDC2P34741 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDC2P34741 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDC2P34741 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDC2P34741 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDC2P34741 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDC2P34741 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDC2P34741 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDC2P34741 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDC2P34741 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDC2P34741 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDC2P34741 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDC2P34741 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDC2P34741 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDC2P34741 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDC2P34741 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDC2P34741 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDC2P34741 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SDC2P34741 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDC2P34741 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDC2P34741 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDC2P34741 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDC2P34741 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDC2P34741 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDC2P34741 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDC2P34741 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDC2P34741 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms