Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB6P28072 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB6P28072 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB6P28072 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB6P28072 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB6P28072 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms