Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
UBTFP17480 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
UBTFP17480 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
UBTFP17480 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
UBTFP17480 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
UBTFP17480 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
UBTFP17480 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
UBTFP17480 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
UBTFP17480 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
UBTFP17480 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
UBTFP17480 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
UBTFP17480 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
UBTFP17480 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
UBTFP17480 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
UBTFP17480 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
UBTFP17480 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
UBTFP17480 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
UBTFP17480 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
UBTFP17480 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
UBTFP17480 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
UBTFP17480 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
UBTFP17480 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
UBTFP17480 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
UBTFP17480 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
UBTFP17480 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
UBTFP17480 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
UBTFP17480 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
UBTFP17480 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
UBTFP17480 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
UBTFP17480 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
UBTFP17480 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
UBTFP17480 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
UBTFP17480 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
UBTFP17480 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
UBTFP17480 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
UBTFP17480 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
UBTFP17480 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
UBTFP17480 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
UBTFP17480 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
UBTFP17480 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
UBTFP17480 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
UBTFP17480 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
UBTFP17480 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
UBTFP17480 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
UBTFP17480 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
UBTFP17480 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
UBTFP17480 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
UBTFP17480 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
UBTFP17480 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
UBTFP17480 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
UBTFP17480 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
UBTFP17480 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
UBTFP17480 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
UBTFP17480 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
UBTFP17480 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
UBTFP17480 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
UBTFP17480 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
UBTFP17480 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
UBTFP17480 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
UBTFP17480 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
UBTFP17480 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
UBTFP17480 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
UBTFP17480 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
UBTFP17480 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
UBTFP17480 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
UBTFP17480 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
UBTFP17480 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
UBTFP17480 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
UBTFP17480 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
UBTFP17480 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
UBTFP17480 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
UBTFP17480 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
UBTFP17480 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
UBTFP17480 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
UBTFP17480 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.26■■■■□ 3.72
UBTFP17480 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
UBTFP17480 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
UBTFP17480 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
UBTFP17480 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
UBTFP17480 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
UBTFP17480 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
UBTFP17480 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
UBTFP17480 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
UBTFP17480 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
UBTFP17480 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
UBTFP17480 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
UBTFP17480 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
UBTFP17480 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
UBTFP17480 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
UBTFP17480 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
UBTFP17480 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
UBTFP17480 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
UBTFP17480 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms