Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPA1P15085 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA1P15085 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA1P15085 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPA1P15085 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CPA1P15085 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA1P15085 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA1P15085 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA1P15085 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA1P15085 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPA1P15085 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA1P15085 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CPA1P15085 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA1P15085 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA1P15085 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CPA1P15085 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPA1P15085 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPA1P15085 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA1P15085 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA1P15085 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA1P15085 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA1P15085 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA1P15085 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA1P15085 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPA1P15085 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPA1P15085 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPA1P15085 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA1P15085 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA1P15085 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPA1P15085 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPA1P15085 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPA1P15085 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CPA1P15085 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPA1P15085 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA1P15085 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA1P15085 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA1P15085 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA1P15085 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPA1P15085 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA1P15085 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA1P15085 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA1P15085 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPA1P15085 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPA1P15085 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPA1P15085 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA1P15085 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA1P15085 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA1P15085 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA1P15085 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPA1P15085 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPA1P15085 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPA1P15085 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPA1P15085 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPA1P15085 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPA1P15085 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA1P15085 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA1P15085 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA1P15085 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA1P15085 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA1P15085 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA1P15085 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA1P15085 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA1P15085 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA1P15085 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms