Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VDRP11473 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VDRP11473 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VDRP11473 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VDRP11473 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VDRP11473 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VDRP11473 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VDRP11473 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VDRP11473 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VDRP11473 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VDRP11473 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VDRP11473 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VDRP11473 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VDRP11473 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VDRP11473 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VDRP11473 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VDRP11473 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VDRP11473 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VDRP11473 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VDRP11473 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VDRP11473 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VDRP11473 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VDRP11473 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VDRP11473 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VDRP11473 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VDRP11473 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VDRP11473 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VDRP11473 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VDRP11473 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VDRP11473 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VDRP11473 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VDRP11473 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VDRP11473 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VDRP11473 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VDRP11473 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VDRP11473 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VDRP11473 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms