Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPSAP08865 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPSAP08865 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPSAP08865 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPSAP08865 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPSAP08865 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPSAP08865 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPSAP08865 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPSAP08865 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPSAP08865 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPSAP08865 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPSAP08865 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPSAP08865 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPSAP08865 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPSAP08865 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPSAP08865 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPSAP08865 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPSAP08865 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPSAP08865 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPSAP08865 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPSAP08865 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPSAP08865 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPSAP08865 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPSAP08865 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPSAP08865 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPSAP08865 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPSAP08865 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPSAP08865 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPSAP08865 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RPSAP08865 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPSAP08865 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPSAP08865 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPSAP08865 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPSAP08865 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPSAP08865 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPSAP08865 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPSAP08865 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPSAP08865 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPSAP08865 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPSAP08865 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPSAP08865 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPSAP08865 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPSAP08865 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPSAP08865 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPSAP08865 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms