Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LPLP06858 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPLP06858 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPLP06858 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPLP06858 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LPLP06858 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LPLP06858 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LPLP06858 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LPLP06858 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LPLP06858 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LPLP06858 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LPLP06858 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LPLP06858 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LPLP06858 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LPLP06858 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LPLP06858 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LPLP06858 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LPLP06858 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPLP06858 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPLP06858 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPLP06858 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPLP06858 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPLP06858 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPLP06858 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LPLP06858 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LPLP06858 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPLP06858 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPLP06858 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LPLP06858 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LPLP06858 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LPLP06858 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LPLP06858 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LPLP06858 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LPLP06858 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPLP06858 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPLP06858 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms