Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCGP05129 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCGP05129 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms