Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYBBP04839 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYBBP04839 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYBBP04839 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYBBP04839 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYBBP04839 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYBBP04839 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYBBP04839 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYBBP04839 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYBBP04839 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYBBP04839 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYBBP04839 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYBBP04839 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYBBP04839 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYBBP04839 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYBBP04839 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYBBP04839 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYBBP04839 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYBBP04839 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYBBP04839 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYBBP04839 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYBBP04839 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYBBP04839 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYBBP04839 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYBBP04839 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYBBP04839 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYBBP04839 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYBBP04839 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYBBP04839 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYBBP04839 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYBBP04839 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYBBP04839 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYBBP04839 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYBBP04839 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYBBP04839 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYBBP04839 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYBBP04839 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYBBP04839 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYBBP04839 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYBBP04839 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYBBP04839 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYBBP04839 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYBBP04839 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYBBP04839 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYBBP04839 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYBBP04839 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYBBP04839 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms