Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL1O95922 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL1O95922 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL1O95922 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL1O95922 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL1O95922 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL1O95922 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL1O95922 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL1O95922 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL1O95922 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL1O95922 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL1O95922 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL1O95922 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL1O95922 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL1O95922 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL1O95922 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL1O95922 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL1O95922 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TTLL1O95922 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL1O95922 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL1O95922 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL1O95922 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL1O95922 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL1O95922 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms