Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT34O76011 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT34O76011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT34O76011 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT34O76011 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT34O76011 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT34O76011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT34O76011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT34O76011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT34O76011 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT34O76011 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT34O76011 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT34O76011 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT34O76011 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT34O76011 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT34O76011 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT34O76011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT34O76011 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT34O76011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT34O76011 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT34O76011 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT34O76011 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT34O76011 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT34O76011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT34O76011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT34O76011 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms