Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSDE1O75534 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSDE1O75534 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSDE1O75534 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms