Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF10O60809 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF10O60809 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
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