Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN2O60636 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN2O60636 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN2O60636 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms