Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNT1O60563 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNT1O60563 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms