Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCMT2O60294 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCMT2O60294 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LCMT2O60294 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms