Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP2O15127 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP2O15127 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms