Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLOD2O00469 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD2O00469 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD2O00469 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms