Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms