Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YJEFN3A6XGL0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
YJEFN3A6XGL0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms