Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSTM2BA6NLU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSTM2BA6NLU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2BA6NLU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms