Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPIPB15A6NHN6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB15A6NHN6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB15A6NHN6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms