Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBE1Q9UJT0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms