Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPASTQ9UBP0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms