Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC180Q9P1Z9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC180Q9P1Z9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC180Q9P1Z9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC180Q9P1Z9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC180Q9P1Z9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC180Q9P1Z9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms