Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNK4Q9NYG8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNK4Q9NYG8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms