Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL3Q9NQ33 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL3Q9NQ33 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms