Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROBO2Q9HCK4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROBO2Q9HCK4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms