Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC2Q9C0B9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms