Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms