Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms