Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms