Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2Q9BX26 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms