Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1orf50Q9BV19 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf50Q9BV19 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms