Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2AFJQ9BTM1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms