Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT11Q9BT88 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms