Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms