Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
RETNLBQ9BQ08 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms