Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms