Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTV1Q96GA3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms