Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms