Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf44Q96CB5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms