Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA6Q92908 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms